| 部 | 室 | 業務内容 | |
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| 理事長 副理事長 常務理事 |
品質保証部 | 品質保証 | |
| 管理部 | 施設課 | 施設設備 | |
| 経理課 | 財務・経理 | ||
| 総務課 | 人事・庶務 | ||
| 技術検査部 | 第一分析室 | 水質・土壌・廃棄物調査 大気・騒音・振動・悪臭調査に関る検査及び分析 |
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| 第二分析室 | |||
| 第三分析室 | |||
| 第五分析室 | |||
| 微生物検査室 | 細菌、微生物に関る検査及び分析 | ||
| 緑の森研究所 | 極微量物質検査 | ||
| 調査室 | 上記の検査に関る採取・調査活動 | ||
| 情報管理室 | 精度管理・共通文書管理 容器・器具洗浄等 |
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| 証明書発行・計量事務・顧客情報管理 | |||
| 業務部 | 業務課 | 環境検査に関る見積・契約・入札参加 | |
| 簡易専用水道 検査課 |
簡易専用水道の管理状況検査 | ||
| 食品薬品部 | 食品化学試験室 | 食品における農薬・動物用医薬品・添加物及び器具、容器包装・おもちゃに関る検査、分析 | |
| 微生物試験室 | 食品における細菌、微生物に関る検査、分析 | ||
| 生物試験室 | 動物を用いた試験 (貝毒検査) | ||
| 薬事試験室 | 薬事法に関る検査、医薬品・医薬部外品等の品質試験 | ||
| GLP管理室 | GLPに関わる対応・書類整備 | ||
| 業務管理室 | 受託・受付、サンプリング及び試験品管理、検査結果書及び検査証明書の発行及び事務 | ||
| 製品安全検査部 | 生活用品・おもちゃ等の試験・検査 |
